Objavljivanjem monografija, studija, hronika sela, priređene arhivske građe ili izložbenih kataloga, objavljeno je preko 70 naslova. Zastupljene su teme iz oblasti istorije, istorije umetnosti, istorije sporta, književnog stvaralaštva, arheologije, etnologije, dijalektologije, političke sociologije, geografije, kao i demografije i drugih oblasti društvenog života.
Pokrenute su četiri posebne biblioteke: Znameniti ljudi i dela, Hronike sela, Kulturna baština i Naši koreni. Istovremeno, katalozima muzejskih izložbi beležena je kontinuirana izložbena aktivnost Muzeja.
Pored pomenutih vidova izdavačke delatnosti štampane su i razglednice, prospekti, plakati i pozivnice za izložbe Muzeja.
Kroz izdavaštvo Muzej godinama čuva duhovno i materijalno nasleđe kao i tradicionalne vrednosti Pirota i okoline.
Svoja izdanja Muzej razmenjuje sa preko 50 institucija sličnog tipa u Srbiji.
Aktuelna izdanja
Panajotović G. Tomislav: Piroćanci (prilog karakterologiji stanovništva pirotskog kraja) – Pirot; Muzej Ponišavlja, 2007 (Pirot; Pi-Pres). – 452 str.: fotogr.; 24 cm.
Tiraž 500. – Rečnik manje poznatih reči: str. 377-428. – Beleška o autoru: 451. – Napomene i bibliografske reference uz tekst. – Bibliografija: str. 256-632. – Registri.
ISBN 978-86-85193-12-5

„Ova studija, zasnovana na pravom naučnom pristupu i odgovarajućim činjeničkim analizama, rešava i otklanja neke nedoumice koje su nastale o „šopskom varijatetu“ i ušle u literaturu u okviru Cvijićevog „Centralnog etnopsihičkog tipa“...“
(izvod iz Recenzije akademika Petra Vlahovića)
Andrejević, Jordan, Andrejević Dragoljub: Rodoslov braće Lečić

Rukopis posvećen rodoslovu braće Lečića, otkriva pravi smisao života, ukazuje na njegov kontinuitet, predočava niz ekonomskih i društvenih elemenata, evocira elemente i sadržaje života na selu, iz opšteg izrasta ka posebnom, iz etnološke teorije i istorije, ka konkretnim porodicama do pojedinaca. Tablice, fotografije, karte i faksimili važnih dokumenata, čine skladnu celinu, čini se prvu te vrste za jedno seosko naselje okoline Pirota...

Katalog izložbe povodom obeležavanja 60 godine rada Muzeja Ponišavlja: Gornji haljeci (iz zbirke Gradske nošnje Muzeja Ponišavlja). Autor Saška Velkova, viši kustos Muzeja.
Aleksić Petar: Ratni i poratni dani (1941-1950), 2007, (Pirot, Cicero) - 108 str. : ilustr. ; 21 cmTiraž 500 ISBN 978-86-85193-14-9

Sećanja autora iskazana kroz 25 podnaslova kojima se dočaravaju vreme i ljudi u godinama koje sada predstavljaju samo jedan deo prošlosti Pirota. Sa distance od 60 godina autor zanimljivo i živo pripoveda o deceniji u kojoj su se zbivali dramatični događaji i procesi kako na ličnom i porodičnom, tako i na opštem planu u životu grada.
Ćirić Nikola: Vek pomena; 2008. (Pirot: Cicero), - 155 str. : ilustr. : 21 cm Tiraž 500 ISBN 978-86-85193-18-7
Knjiga je posvećena jačanju višedecenijskog srpsko-grčkog prijateljstva. Inspirisana je stradanjiva grčkih vojnika u Pirotu i njegovoj okolini 1919. godine. Karakteriše je izrazita dokumentarnost koja ima svoje opravdanje u činjenici da je autor dugogodišnji pirotski novinar.
Lilić Borislava: Srpsko i grčko vojničko groblje u Pirotu. Institut za političke studije i Muzej Ponišavlja Pirot, 2008 (Pirot : Cicero). - 108 str. : ilustr, ; 22 cm. Uporedo srpski tekst i engleski prevod. Tiraž 1000 ISBN978-86-7419-130-9 (IPS)

Ova knjiga - spomenica - posvećena je jubileju 90-godišnjici završetka prvog svetskog rata. Povodom 90-godišnjice završetka Prvog svetkog rata i učešća srpske i grčke vojske u proboju Solunskog fronta, zahvalna potreba je da se sa najdubljim pijetetom i divljenjem vratimo još jednom na taj herojski period i oživimo događaje i sećanja iz oslobodilačkih ratova srbije 1912-1918. godine i blistavu epopeju 3. pešadijskog puka Piroćanaca. Spomenica čuva, na jednom mestu, sećanje na postradale Grke, 1919. u Pirotu, kao i na borce, Piroćance, 3. pešadijskog puka


Naslovi u izdanju Muzeja Ponišavlja:
1. Rančić, Ćira: Iz mog zavičaja, 1969.
2. Rančić, Dimitrije: Gugutće na direci - stihovane kanurke sa treperavih niti ćilima davna, Pirot, 1973.
3. Vasić, dr Todor: Sindikalni pokret u Pirotu - Od esnafske uredbe do radničkog samoupravljanja, Pirot, 1973.
4. Kostić, N. Kosta: Istorija Pirota, priredio I. Nikolić, 1973.
5. Mitić, Mr Čedomir: Spas kose u bilju - biljni recepti protiv opadanja kose, 1974.
6. Najdanović, Branislav i Petković, Milica: Muzički dani dr Vojislava Vučkovića, 1974.
7. Nikolić, M. Vladimir: Stari Pirot - etnološke beleške iz prošlosti grada, priređivač dr Ilija Nikolić, Pirot, 1974.
8. Ćirić, V. Jovan i Živković, V. Vitomir: Krupac-geografija, istorija društveni život, NOR, Pirot, 1974.
9. Osnovna škola Vuk Karadžić 1815 - 1975, spomenica, Pirot, 1975.
10. Tefter Nišavske mitropolije 1834 - 1872, priredio dr Ilija Nikolić, Pirot, 1976.
11. Božidar, J. Zdravković: Od Alačev Čivlika do Velikog Jovanovca, Pirot, 1976.
12. Kozić, Petar: Pirotska komuna 1920, 1980.
13. Naših šest decenija, 1981 - Pedagoška akademija.
14. Nikolić Dr Ilija: Pirot i Srez nišavski, arhivska graća I , II , III , 1981.
15. Arheološko blago Ponišavlja, 1983.
16. Jovanović, Borisav: Činiglavci - etnološko - istorijski prilozi, Pirot, 1984.
17. Petrović, Vukašin: Hronika sela Velika Lukanja, 1985.
18. Đorđević, Božidar i Todorović, Petar: Naših trideset godina 1957 - 1983, Pirot 1985.
19. Panajotović, Tomislav: Adeti, Život i običaji stanovništva pirotskog kraja, Pirot, 1986.
20. Akvareli Milene Nikolić, Pirot, 1986, katalog izložbe.
21. Džo In Fan, 1986, katalog izložbe.
22. Osnovna škola u Temskoj 1836 - 1986, 1987.
23. Vlajković, Radovan: Skupštinski izbori u Pirotskom okrugu, 1878 - 1914. Pirot, 1988.
24. Slike i skulpture S.Totić, B.Krstić, katalog.
25. Zlatković, Đorđe M. katalog izložbe.
26. Jovica Ilić, Ozrenka Majstorović, Pirot, 1986, katalog izložbe.
27. Pirotski grad, Pirot, 198?
28. Akvareli Milene Nikolić Mijalković, Pirot, 1986.
29. Živković, Novica: Rečnik pirotskog govora, Pirot, 1987.
30. Miroslav Živković, Pirot, 1988, katalog izložbe.
31. Dušan Jovanović, slike, Pirot, 1988, katalog.
32. Minčić, Vukašin: Upoznaj svoj zavičaj, Pirot, 1989.
33. Miroslav Živković, slike, Pirot, 1990, katalog.
34. Nebojša Petrović, slike i crteži, Pirot, 1990, katalog.
35. Treća majska izložba likovnih umetnika Piroćanaca, Pirot, 1990 katalog.
36. Branko Manojlović, retrospektivna izožba slika i crteža, Pirot , 1991.
37. Arheološka istraživanja - stalna izložba, Pirot, 1991, katalog.
38. Velimir Đorđević, keramika, Pirot, 1992, katalog.
39. Četvrta majska izložba likovnih umetnika amatera Piroćanaca, Pirot, 1993, katalog.
40. Lica, Slobodan Roksandić, Pirot, 1993, katalog.
41. 50 godina Muzeja Ponišavlja u Pirotu, Pirot, 1997. katalog.
42. Dom Hriste Jovanovića 1848 - 1998, Pirot, 1998.
43. Živković, Novica: Gora bršljanova - narodne pesme pirotskog kraja, Pirot, 1998.
44. Miroslav Živković, katalog izložbe, Pirot, 2000. katalog.
45. Antonije Milošević, Ikone, Pirot, 2001. katalog.
46. Vez u Pirotu u 19. veku i prvoj polovini 20. veka, Pirot, 2001. katalog.
47. Đorđević Najdan R. : Hronika sela Ponor, Pirot , 2001.
48. Andonović, Jovan: Stavrijini vicevi, Pirot, 2001.
49. Zlatković, Dragoljub: Sramotno i pogano u pirotskom govoru, Sofija, Muzej suizdavač ( Dios i Ekolibri ), 2001.
50. Živković, Vitomir: Pirotska golgota 1885-1886, Pirot, 2001.
51. Cvetković, Duhomir: Hronika sela Kostur, Pirot, 2001.
52. Vez u Pirotu, 2001. katalog izložbe.
53. Spasić, Časlav: Hronika sela Prisjan, Pirot, 2001.
54. Zlatarstvo, kujundžiluk i nakit Gornjeg Ponišavlja kroz vekove, suizdanje sa Narodnim muzejem iz Niša, Niš-Pirot, 2003 . katalog.
55. Nikolić, dr Ilija: Piroćanci i Kragujevčani u protokolima kragujevačkog suda, Pirot, 2003.
56. Marinković, Gradimir: Hronika sela Babin Kal, Pirot, 2003.
57. Staklo i porcelan Pirota - kraj 19. i početak 20. veka, Pirot, 2003. ,katalog
58. Nedeljković, dr Jasmina: Govor Pirota u 18. veku, Muzej suizdavač sa Narodnom bibliotekom iz Beograda i Narodnom bibliotekom iz Pirota, 2003.
59. Iz kovčega porodice Hristić, Pirot, 2004, katalog.
60. Pejić, Negica i Nikolić, Ilija: Kolo srpskih sestara, Pirot, 2004.
61. Živković, Hristifor: 80 godina fudbala u Pirotu, Pirot, 2004.
62. Aleksić, Petar: Likovi iz senke, Pirot, 2004 .
63. Građanski duh Pirota, Ranćel i Jovanka Hadži Minović, Pirot, 2005. katalog.
64. Nikolić, dr Ilija: Narodne pesme Pirota i okoline, 1841 - 1964, književno - istorijska istraživanja, Pirot, 2005.
65. Garotić, dr Sreten: Braća Garotić, Trgovačka kuća izvoznik pirotskih ćilimova ( 1869 - 1948 ), istorija jedne pirotske porodice, Pirot, 2005.
66. Mitić, Vukadin: Vranište, Biblioteka hronika sela, Pirot, 2005.
67. Sanjarenje, skulpture, Pirot, 2005, katalog izložbe.
68. Ćirić, mr Branislav: Sokolski pokret i DTV Partizan, Pirot, 2006.
69. Kovčezi Pirota i okoline, Pirot, 2006, katalog.
70. Živković, Magdalena: Živkovići, Pirot 2006.
71. Čarape Pirota i okoline, Pirot,katalog 2004.
72. Impresije - Dejan Cvatković, katalog 2007.
73. Kopije fresaka Đorđe Marinković, katalog 2007.
74. Kuvarice - Kuvarica što je mlađa večera je odma slađa, katalog 2007.
75. Momčilo Fundup, katalog izložbe, 2007.
76. Antić Radomir - Izložba slika Radomira Antića. Izdavač Etnografski muzej Ponišavlja, Pirot, 29. novembar - 25 decembar. Štampa "Grafika " Pirot, 1967. - Mišljenja likovnih kritičara o izložbama njegovim. Sa slikom autora na koricama i biografskim podacima na kraju kataloga.
77. Gornji haljeci ( iz zbirke Gradske nošnje Muzeja Ponišavlja ).
78. Panajotović G. Tomislav, Piroćanci ( prilog karakterologiji stanovništva pirotskog kraja) Pirot, 2007.
79. Aleksić, Petar: Ratni i poratni dani ( 1941-1959), Pirot, 2008.
80. Borislava Lilić, Srpsko i grčko vojničko groblje, Institut za političke studije Beograd i Muzej Ponišavlja, Pirot, 2008.
81. Ćirić, Nikola, Vek pomena, Pirot, 2008.
82. Andrejević Đ.Jordan, Andrejević K. Dragoljub: Rodoslov braće Lečića, Pirot, 2008.
|